MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. KJ006 chromosome 2

Total Repeats: 59314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017921	GCTC	2	8	218	225	0 %	25 %	25 %	50 %	387903681
2	NC_017921	GC	3	6	255	260	0 %	0 %	50 %	50 %	387903681
3	NC_017921	CGC	2	6	330	335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903681
4	NC_017921	CGC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903681
5	NC_017921	TCGA	2	8	358	365	25 %	25 %	25 %	25 %	387903681
6	NC_017921	CTG	2	6	383	388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903681
7	NC_017921	TCG	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903681
8	NC_017921	ACC	2	6	558	563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387903682
9	NC_017921	GCC	2	6	585	590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903682
10	NC_017921	ACC	2	6	594	599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387903682
11	NC_017921	CGG	2	6	612	617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903682
12	NC_017921	TCG	2	6	636	641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903682
13	NC_017921	TCG	2	6	654	659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903682
14	NC_017921	GACGC	2	10	715	724	20 %	0 %	40 %	40 %	387903682
15	NC_017921	GCA	2	6	751	756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903682
16	NC_017921	GC	3	6	766	771	0 %	0 %	50 %	50 %	387903682
17	NC_017921	CCG	2	6	772	777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903682
18	NC_017921	CGG	2	6	815	820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903682
19	NC_017921	CGC	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903682
20	NC_017921	GCT	2	6	882	887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903682
21	NC_017921	AAC	2	6	891	896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387903682
22	NC_017921	GCA	2	6	901	906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903682
23	NC_017921	GC	3	6	935	940	0 %	0 %	50 %	50 %	387903682
24	NC_017921	CA	3	6	975	980	50 %	0 %	0 %	50 %	387903682
25	NC_017921	CGAGC	2	10	1064	1073	20 %	0 %	40 %	40 %	387903682
26	NC_017921	CCG	2	6	1084	1089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903682
27	NC_017921	CG	3	6	1244	1249	0 %	0 %	50 %	50 %	387903682
28	NC_017921	GC	3	6	1259	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	387903682
29	NC_017921	CGCA	2	8	1321	1328	25 %	0 %	25 %	50 %	387903682
30	NC_017921	CGA	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903682
31	NC_017921	GCGCG	2	10	1498	1507	0 %	0 %	60 %	40 %	387903682
32	NC_017921	TCG	2	6	1527	1532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903682
33	NC_017921	TCG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903682
34	NC_017921	CGC	2	6	1603	1608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903682
35	NC_017921	GTA	2	6	1610	1615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387903682
36	NC_017921	GCC	2	6	1641	1646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903682
37	NC_017921	GCG	2	6	1655	1660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903682
38	NC_017921	CG	3	6	1711	1716	0 %	0 %	50 %	50 %	387903682
39	NC_017921	GCA	2	6	1738	1743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903682
40	NC_017921	CGC	2	6	1744	1749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903682
41	NC_017921	GC	3	6	1748	1753	0 %	0 %	50 %	50 %	387903682
42	NC_017921	ACG	2	6	1783	1788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903682
43	NC_017921	TGA	2	6	1789	1794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387903682
44	NC_017921	CGAG	2	8	1888	1895	25 %	0 %	50 %	25 %	387903682
45	NC_017921	CG	3	6	1936	1941	0 %	0 %	50 %	50 %	387903682
46	NC_017921	TCGCG	2	10	1950	1959	0 %	20 %	40 %	40 %	387903682
47	NC_017921	CGA	2	6	1981	1986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903682
48	NC_017921	CGT	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903682
49	NC_017921	GCGTC	2	10	2047	2056	0 %	20 %	40 %	40 %	387903682
50	NC_017921	AGAT	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	387903682
51	NC_017921	GCG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903682
52	NC_017921	CGAC	2	8	2119	2126	25 %	0 %	25 %	50 %	387903682
53	NC_017921	CGT	2	6	2185	2190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903682
54	NC_017921	CG	3	6	2218	2223	0 %	0 %	50 %	50 %	387903682
55	NC_017921	GCG	2	6	2226	2231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903682
56	NC_017921	CGACAG	2	12	2297	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903682
57	NC_017921	CTCG	2	8	2321	2328	0 %	25 %	25 %	50 %	387903682
58	NC_017921	CG	3	6	2380	2385	0 %	0 %	50 %	50 %	387903682
59	NC_017921	GCC	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903682
60	NC_017921	GCG	2	6	2431	2436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903682
61	NC_017921	ACG	2	6	2467	2472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903682
62	NC_017921	TCG	2	6	2485	2490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903682
63	NC_017921	GC	3	6	2509	2514	0 %	0 %	50 %	50 %	387903682
64	NC_017921	CCG	2	6	2517	2522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903682
65	NC_017921	GTC	2	6	2555	2560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903682
66	NC_017921	CGT	2	6	2572	2577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903682
67	NC_017921	GCC	2	6	2582	2587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903682
68	NC_017921	GAC	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903682
69	NC_017921	TTG	2	6	2646	2651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387903682
70	NC_017921	CGGG	2	8	2706	2713	0 %	0 %	75 %	25 %	387903682
71	NC_017921	GCG	2	6	2731	2736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903682
72	NC_017921	CGT	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903682
73	NC_017921	GCC	2	6	2933	2938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903683
74	NC_017921	TCGCC	2	10	2942	2951	0 %	20 %	20 %	60 %	387903683
75	NC_017921	CGCGC	2	10	2952	2961	0 %	0 %	40 %	60 %	387903683
76	NC_017921	TCG	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903683
77	NC_017921	TCG	2	6	3010	3015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903683
78	NC_017921	GCA	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903683
79	NC_017921	AGC	2	6	3040	3045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903683
80	NC_017921	GC	3	6	3044	3049	0 %	0 %	50 %	50 %	387903683
81	NC_017921	CGC	3	9	3047	3055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903683
82	NC_017921	CAC	2	6	3063	3068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387903683
83	NC_017921	CGGC	2	8	3098	3105	0 %	0 %	50 %	50 %	387903683
84	NC_017921	GCG	2	6	3149	3154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903683
85	NC_017921	CGT	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903683
86	NC_017921	TCGA	2	8	3190	3197	25 %	25 %	25 %	25 %	387903683
87	NC_017921	CG	4	8	3231	3238	0 %	0 %	50 %	50 %	387903683
88	NC_017921	TGG	2	6	3260	3265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387903683
89	NC_017921	CAG	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903683
90	NC_017921	TGA	2	6	3341	3346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387903683
91	NC_017921	GCC	2	6	3366	3371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903683
92	NC_017921	ACG	2	6	3394	3399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903683
93	NC_017921	CCG	2	6	3400	3405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903683
94	NC_017921	GTC	2	6	3427	3432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903683
95	NC_017921	CGA	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903683
96	NC_017921	GCCG	2	8	3537	3544	0 %	0 %	50 %	50 %	387903683
97	NC_017921	CG	3	6	3564	3569	0 %	0 %	50 %	50 %	387903683
98	NC_017921	CCG	2	6	3578	3583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903683
99	NC_017921	GCG	2	6	3660	3665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903683
100	NC_017921	ATC	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387903683
101	NC_017921	CGG	2	6	3677	3682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903683
102	NC_017921	AGC	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903683
103	NC_017921	GAC	2	6	3825	3830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903683
104	NC_017921	CGC	2	6	3851	3856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903683
105	NC_017921	AAC	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387903683
106	NC_017921	T	6	6	4066	4071	0 %	100 %	0 %	0 %	387903684
107	NC_017921	CGA	2	6	4073	4078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903684
108	NC_017921	GCCG	2	8	4096	4103	0 %	0 %	50 %	50 %	387903684
109	NC_017921	TC	3	6	4154	4159	0 %	50 %	0 %	50 %	387903684
110	NC_017921	TGCC	2	8	4165	4172	0 %	25 %	25 %	50 %	387903684
111	NC_017921	GCCT	2	8	4223	4230	0 %	25 %	25 %	50 %	387903685
112	NC_017921	GC	3	6	4248	4253	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
113	NC_017921	TGC	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903685
114	NC_017921	GCC	3	9	4290	4298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903685
115	NC_017921	GCCG	2	8	4310	4317	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
116	NC_017921	CG	3	6	4330	4335	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
117	NC_017921	CAGG	2	8	4341	4348	25 %	0 %	50 %	25 %	387903685
118	NC_017921	CGGC	2	8	4357	4364	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
119	NC_017921	CGGCCG	2	12	4372	4383	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
120	NC_017921	CGA	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903685
121	NC_017921	GCC	3	9	4416	4424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903685
122	NC_017921	CCG	2	6	4453	4458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903685
123	NC_017921	CGG	2	6	4460	4465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903685
124	NC_017921	CCGG	2	8	4467	4474	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
125	NC_017921	GCG	3	9	4504	4512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903685
126	NC_017921	CG	4	8	4511	4518	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
127	NC_017921	CCA	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387903685
128	NC_017921	CGG	2	6	4607	4612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903685
129	NC_017921	GCC	2	6	4632	4637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903685
130	NC_017921	GACC	2	8	4694	4701	25 %	0 %	25 %	50 %	387903685
131	NC_017921	AGC	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903685
132	NC_017921	GCT	2	6	4826	4831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903685
133	NC_017921	CCG	3	9	4843	4851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387903685
134	NC_017921	ACCA	2	8	4857	4864	50 %	0 %	0 %	50 %	387903685
135	NC_017921	CG	3	6	4893	4898	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
136	NC_017921	CG	3	6	4965	4970	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
137	NC_017921	GCCG	2	8	4997	5004	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
138	NC_017921	GC	4	8	5015	5022	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
139	NC_017921	CGG	2	6	5030	5035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903685
140	NC_017921	CG	3	6	5063	5068	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
141	NC_017921	GCCG	2	8	5141	5148	0 %	0 %	50 %	50 %	387903685
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156	NC_017921	CTG	2	6	5640	5645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903685
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162	NC_017921	CGA	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387903685
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249	NC_017921	GCG	2	6	9585	9590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387903687
250	NC_017921	TCG	2	6	9594	9599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903687
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252	NC_017921	T	6	6	9717	9722	0 %	100 %	0 %	0 %	387903687
253	NC_017921	TCGC	2	8	10836	10843	0 %	25 %	25 %	50 %	387903688
254	NC_017921	TGA	2	6	10869	10874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387903688
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257	NC_017921	TCG	2	6	11077	11082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903688
258	NC_017921	GCT	2	6	11140	11145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387903688
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260	NC_017921	CTT	3	9	11392	11400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387903688
261	NC_017921	CG	3	6	11414	11419	0 %	0 %	50 %	50 %	387903688
262	NC_017921	GT	3	6	11473	11478	0 %	50 %	50 %	0 %	387903688
263	NC_017921	GGT	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387903688
264	NC_017921	CAC	2	6	11527	11532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387903688
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266	NC_017921	TCAG	2	8	11576	11583	25 %	25 %	25 %	25 %	387903688
267	NC_017921	TGCG	2	8	11708	11715	0 %	25 %	50 %	25 %	387903688
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392	NC_017921	GC	4	8	17837	17844	0 %	0 %	50 %	50 %	387903693
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396	NC_017921	GC	4	8	17967	17974	0 %	0 %	50 %	50 %	387903693
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